Liste magi


Ofte når man jobber med DNA så jobber man med ulike former for lister. Enten fordi man samarbeider med slektninger og utveksler lister, eller fordi man administrerer DNA for flere og av den årsak har flere lister. Man kan bruke listene til å finne ut mer enn bare ved å se på sin egen lille liste isolert.

Nedenfor viser jeg deg Hvordan bruke excel til å jobbe for deg med å sortere ut forskjeller, eller likheter mellom 2 lister. (Jeg bruker Office 365 PC versjon). Fremgangsmåten er forenklet og veldig generell fordi ulike selskaper har ulik former på sine lister. (MyHeritage lister må bearbeides litt før de kan brukes*  Listen jeg bruker her, er ekstrem enkel.  (Denne bruksanvisning i pdf, med bilder + demofiler)

* MyHeritgage matchlister inneholder «ID for deg» – «ID for treffperson», Din ID må fjernes om du skal sammenligne lister fra ulike personer. Første linje ID hos MH kan se slike ut: D-52B0754F-8EFF-36AA-9B05-B56ACC6F359E-D-1E0A3A3A-85BC-45F6-A26F-D0A019615CDF, har markert ut hva som må bort.

Forutsetninger:

  • Excel
  • 2 filer av samme oppbygging
    • Excel filer eller filer med tabellarisk struktur (komma, semikomma, tab separert, eller fast feltlengde). Filene må ha kolonner og rader
ID;NAVN;cM
AE123;Dag Holte;1876
WD541;Runa Grøndahl;3560

Fremgangsmåte:

  1. Åpne excel
  2. Gå til data fanen. Velg rett å åpne rett filtype (dette eksempelet har csv filer)
  3. Velger «DNA_MOR.CSV», trykker «importer»
  4. Trykker «Last inn»
  5. Endrer navnet på arket til «Mor»
  6. Gjentar punkt 2-5 for «DNA_BARN.CSV»

Like i begge lister (morsslekt)

  1. Hent data, Kombiner spørringer, Slå sammen
  2. Velg
    1. Data kilder DNA_BARN, DNA_MOR
    2. Kolonne som skal være lik i begge (Klikk på tittelfelt for å aktivere)
    3. Sammenføy type:
      1. indre == like i begge
    4. Trykk ok. (Kan du ikke trykke ok, har du trolig glemt pkt 2. kolonne som skal være lik)
  3. Lukk og last inn (Du får nå nytt ark med det som er likt i begge lister)
  4. Gi arket nytt fornuftig navn (I dette eksempelet er ett naturlig valg å kalle det morsslekt)
  5. Endre navn på spørring ifra Merge1 til Morsslekt (høyreklikk på navn i spørringer i høyre marg, velg endre navn)

Farsslekt

Dersom man ikke har en far hvor er dennes slektninger?
Svar: De vil hovedsaklig være de som moren ikke har, men barnet har

Vi tenger å vite hvem er i listen til barnet, men ikke er felles med mora.

Gjør som over, men velg

  • kilde: DNA_BARN (først), Morslekt 
  • sammenføy type,  «Anti – bare rader i første»
  • lukk og last inn
  • Navngi arket og spørringen «Farslekt»

AUTOMAGI

Du har nå koblet ditt regneark til 2 eksterne datakilder.  Lagd 2 lister hvor du har delt inn slekta etter mor og far. Får du nye lister kall de det samme og overskriv de gamle listene. Sidene dataene ligger utenfor og er oppdatert, alt du trenger å gjøre i ditt regnerak er å gå til arkfane «Data» og trykk på ikon for Oppdater alt. (Mener bestemt at tastekombinasjonen Alt+F9 er hurtigtasten, for oppdatert alt)

Alle dine lister vil ha oppdatert seg i regnearket, helt automagisk.

En mulig utvidelse er å lage en masterliste for hver av dine dna personer. Om du døper om den nye lista til «person»_ny kan du ha en lignende spørring som ser om det er noen nye i listen og legge disse til i master listen. Hvordan du gjør dette er likt det du har gjort her, men du må velge Full ytre, og senere finne funksjonen fjern duplikater (menypunkt under Data)

Hva er oddsen?


Bakgrunn

What are the Odds? eller WATO som noen forkorter dette til, er ett verktøy på «DNA Painter» sittt nettsted som er verdt å undersøke. Spesielt om du ikke vet hvordan man skal plassere noen inn slekta og du vil leke med mulighetene.

Eksempelet som brukes er 80% oppdiktet. Det eneste som er reellt at Bjarne Betjent er født ca 1945, oppgitte cM verdier (andel delt DNA) og at han har en ukjent far. Dette er gjort for å skjule identiteten til nålevende, og det er uenighet om hvordan "Bjarne" passer inn i slekta.

Bjarne Betjent har fått nokså 2 nære treff på 564,2 og 444 cM med noen som han antar er på hans fars side, Bodil og Johan. Andre disse også DNA treff med er Inger, Lisa, Julie, Tove samt Vivian. Alle treffene var på Gedmatch. Men ingen av disse 2 treffene er synlig i slekt med hverandre.

Hvordan kommer man videre? Jo man må finne ut hvordan folkene er innbyrdes i slekt med hverandre å tegne slektstrær. Hvordan kan man det, jeg vet bare at de er i slekt med meg?

På Gedmatch kan man se sine treff, og man kan se sine treffers treff. (egentlig alle sine treff). Nøkkelen er å bruke GedmatchID, Gedmacth er en åpen dna database som lar (alle sine registrete brukere) se den informasjonen du har lagt inn i databasen, unntatt hvilken DNA kode du har*)

*) Matcher du noen på kromosonene fra plass 50420 til 51620 og du vet hva du har av dnakode i dette område, vet du hva den andre også har mellom disse punktene, og bare der. Du vet ett lite fragment av ett lite fragment av hva denne personen har. En autosomal test avslører 0,02% av ditt DNA om du deler hele "koden" du fikk kartlagt, (ca 700.000 av 3 milliarder bokstaver) så om du eksponerer 1200 av dine 3 milliarder bokstaver så ville jeg ikke bekymret meg over dette.

En nøkkel til å DNAforske slekt på er å bruke «shared cM project» på DNA Painter. Taster man delt DNA i cM verdi får man opp hvilke relasjoner som er mulige, med sannsynligheter. (Med MyHeritage får du dette direkte i 1-1 trefflisten). Ved å se på trefflisten til de ulike matchene på Gedmatch fant man følgende relasjoner:

NavnTrecMSlektskap
BodilA0564,2Mor til Tove og Vivian
ToveA1256,7Datter av Bodil
VivianA2224,3Datter av Bodil
JohanB0444 Onkel til Inger og Lise
IngerB1239,7Niese av Johan.
LisaB2 269,6Niese av Johan. Mor til Julie
JulieB21195,4Datter av Lisa

Ved å kontakte noen i slekta til Bodil og Johan fikk man vite at ovenstående stemte, og at familiene hang sammen på følgende måte:

* angir hviken søsken som er forelder for neste generasjon

Utfylling av WATO

For å kunne bruke «What are the odds» må man starte med en kjent ane. I eksemplet ovenfor er dette ikke tilfelle. Dette er 2 slekter med en felles forbindelse. Dette betyr at man kan tegne 2 (4) forskjellige tavler. Hver boks i WATO kan være ett par, eller en person. Tegner derfor opp 2 tavler; Etterkommere av Truls, deretter Ingrid. (Å tegne opp nedenstående er ganske enkelt, forklarer ikke hvordan jeg kom dit. Utfordringen med å bruke verktøyet kommer i neste steg). Bare de du har en cM verdi på skal oppgis med dette. Det er disse’s delt DNA som brukes videre i teoriene.

Teorier – hvordan passer Bjarne Betjent inn?

WATO virker ikke med mindre man har flere teorier. Man kan ikke bare putte inn det man tror er rett og få ett svar. Hele poenget med dette verktøyet er å analysere hvilke teorier kan være rett. Når man har store andel delt DNA typisk foreldre/barn, søskenbarn, halvsøsken trenger man egentlig ikke dette verktøyet. Det holder med å bruke «shared cM prosject» i slike tilfeller. Prøver nevø/niese for å vise hva man velger (ikke fordi det er en god teori).

Hypotese kommer ut med score 0 (bilde under), som betyr usannsynlig. Døper om barn av Edna til hel/halv (fordi jeg skal vise hvordan legge til halvsøsken), samt se hvordan det slår ut.

Skal være halvsøsken til alle de andre søskene. Velger derfor alle

Tester alle avkom i hver generasjon av «halvsøskenet». Hypotese 3 får høyest tall, som betyr det er mest sannsynlig.

Rapporten under grafen som tegner opp er viktig å sjekke, den oppsummerer alle funnen på alle teoriene. Foreløpig sier den dette:

Hypotese 3 er 1178x mer sannsynlig. OBS! Dette betyr ikke at den som er mest sannsynlig, er den faktiske forbindelsen. Kan noe være mulig så kan det være mulig. LIvet er fult av tilfeldigheter! Vi har fortsatt mange andre alternativer som ikke er utforsket. Legger til alle mulige varianter jeg kan komme på for denne delen av slekta. Så få vi se hva som dukker opp:

De med «no» emoji, passer ikke pga alder

Lagde de alternativer jeg kom på, men flere av disse passer ikke inn om alder på far i forhold til fødsel av Bjarne Betjent. Satte emoji på de alternativer som ikke går opp, og fjerner før neste bilde.

WATO diagram familiegren 1: 4 ulike alternativer er like sannsynlige! Må derfor se på den andre famliegrenen

Familiegren 2

Viser bare oppsumeringen og ikke hvordan jeg kom dit i detalj. Tar hensyn til at Bjarne sin far kan ikke være født senere enn ca 1930, siden Bjarne er født ca 1945.

WATO – del 2

WATO diagram for famlien over

Konklusjon

Om man tar ett steg tilbake og ser på opplysningene pånytt. Hva er det som utmerker seg med dette tilfelle? I jakten på en ukjent forelder, så har man 2 familiegrupper som ikke er i slekt med hverandre, men er forbundet via en tredje person. Det logiske er at det er personen som er nøkkelen. Reiulf, eller en av hans sønner må være faren til Bjarne Betjent. Alternativt en helbror av han og eller sønn av denne, eller helsøsters sønn. Men han har neppe en helsøsken fordi han er ett resultat av ett flyktig forhold, så det må være han. Slektskap til begge «klyngene» er ikke mulig på andre måter. Folk som leter etter ukjent far er som regel ikke så heldig å ha denne familietvisten. Slekt som er mulig pga 2 halv familier, som ikke er i slekt med hverandre men bare «deg» via din ukjent ane.

Kombinasjonene av begge WATO diagrammene understøtter denne teorien. Dette er mest plausible forklaringen om man ser på alle fakta samlet. Mener du noe annet ta gjerne kontakt!

Bli konge på familehaugen du og!


Familieklynger hjelper deg til å forstå hvor andre hører hjemme i din slekt. Genetic Affairs har gitt MyHeritage tilgang til deres verktøy for å lage familieklynger. Her er noen tips for at du skal kunne mestre dette verktøyet du og.

Liten advarsel, selv om man deler dna med noen er dette ikke et endelig bevis på slektskap, men en meget sterk indikasjon. Slektsforskning må til. Mengden delt dna spiller inn, små mendger kan tilfeldigvis kommet fra ulike grener og dermed mistolkes, slik at man finner likt dna ved tilfeldigheter og ikke fordi man har felles opphav – IBC – Identified by Chance. Siden grenseverdiene er satt nokså høyt er det normalt å se relle slektninger i klyngerapporten.

Intro

Har du DNA hos MyHeritage og premium abonnement eller bedre kan du be om å få tilsendt en «Auto cluster» rapport. (Cluster = Klynge). Dette er en sammenligning av dine matcher som deler mellom 30 og 350 cM *) med hverandre. På «Genetic Affairs» kan kunder hos 23andMe, Ancestry og FamilyTreeDNA abonnere på sine matcher, og selv bestemme hvor ofte man skal få denne rapporten, samt utifra hvilke grenseverdier. Hos MyHeritage kan du bestille rapporten manuelt 1 gang pr døgn.

*) Usikker på om disse verdiene justeres automatisk basert på dine data, men antar dette.

Alle matcher sammenlignes mot hverandre. Forenklet betyr dette om Person A,B,C og D matcher deg så sjekkes A mot ABCD, så B mot alle osv. Deler 2 personer segmenter merkes krysningspunktet mellom de med en farge. Flere med samme farge betyr de tilhører en klynge av folk som innbyrdes deler DNA. Alle innad i en slik gruppe trenger ikke å ha arvet samme hele segment, men innbyrdes så deler de DNA på ett eller flere segment.

Samme farge = Samme familieklynge / familiegruppe

Hvordan tolke rapporten grafisk

(1) Hvem er Derek i slekt med?


  • Går man først horisontalt bortover og kikker opp ser man at han er i slekt med seg selv. Krysningspunktet er merket med (rød)farget boks.
  • Neste person er Stephanie. Hun ser ikke ut til å være en match. Her kan vi bli lurt. De kan dele mindre enn 30 cM seg i mellom. Isolert sett kan man derfor ikke si de er i slekt med hverandre utifra denne rapporten. (Det er sterke indisier for at de er i slekt, fordi de begge er si slekt med andre som er i samme røde grupppe A).
  • Fortsetter vi bortover er; Samantha, Gerald, Jan og Desiree også i samme familiegruppe.
  • Kikker vi lengst bort finner vi en grå boks. Derek ser ut til å være i slekt med Maritha, men slektskapet er grått. Forklarer dette bedre i detalj rett nedenfor.

(2) Grå utenforliggere (Spøkelsene)

  • Alle i en gruppe 1, er grå. Dette betyr at de slekt med flere grupper, De får derfor ikke en entydig farge utenfor sin egen nærmeste gruppe. De er «spøkelser» som viser at det er en forbindelse mellom de ulike klyngene/familiene. (spøkelser er «mitt» ord, i mangel av noe bedre å kalle det)
  • Ser vi på Bernt Ole er han i slekt med 3 stk grå (Jan, Frida, Paulette). Disse tilhører egentlig rød gruppe A, men han er også i familie med folk i grønn gruppe D (Seg selv, Kerry, Maritha).
  • Alle 7 i gruppe 1 ser ut til å være i klynge D, men også i slekt med noen i klynge A. Om du tenker etter er kanskje noen av dine søskenbarn i slekt med deg via din morsslekt, andre søsken barn er i slekt med deg via din farsside. Dette betyr ikke at disse grå er i slekt med deg både via far og mor, men att dine «cousins» kan være på forskjellige grener. men det kan være på samme side av en familie også fordi søskenbarn arver ulike biter av sine felles besteforeldre/oldeforeldre. Noen kan også være i slekt med deg lengre bak i anetreet og derfor være litt i slekt med begge grener.

(3) Grå spøkelser er hint

  • Bernt Ole og Kerry i slekt med Jan som igjen er slekt med alle i rød gruppe. (Se på jan horrisontalt). Vi så på Bernt Ole i forrige runde, Kerry er lik Bernt bortsett fra at Bernt macther Dale og det gjør ikke Kerry. Derimot matcher Kerry, Maritha og det gjør ikke Bernt Ole.
  • Videre undersøkelser på segmenter må gjøres. De grå forbinder 2 grupper hovedsaklig fordi de man må se på at de er slekt med en som er i gruppen. De hinter sterkt om slektskap mellom disse klyngene. Jo flere grå utenforliggere mellom 2 jo sterkere indisie. Totalt er der 7 grå i gruppe 1. Men det kan bli for mange også slik at man ikke ser åpenbare sammenhenger. Noe som er vanlig med steder hvor alle er i slekt med alle, eller folkegrupper gifter seg bare innen sin religion/kaste.

(4) Alle matcher hverandre


  • Alle i klynge C er innbyrdes i slekt med hverandre. Jeg ser dette fordi alle matcher hverandre – og vises som en perfekt forkant. Av dette kan man også anta at det er trolig er nært slektskap de i mellom. (Alle triangulerer på minst ett delt segment – se lengst ned på siden at dette stemmer)
  • Fra «Theorem om slektskap», vet jeg at alle disse har samme stamfar/mor. Suzette er mor til Kyle, Debbie og Alison. Dag Albert er min mors tremenning. (Suzette har jeg forøvrig korrespondert med endel uten å vite at det er tatt DNA test av hennes barn. Jeg har slektsforsket endel på hennes kobling til meg. Jeg avviste nemlig først hennes forfar som en del av min slekt basert på feilaktig oppført fødested hos henne og «alle» andre på MH (Stangeby, Hedmark), men personen viste seg å være en «Stangeby» fra Hof i Vestfold.
  • At alle ikke får en farget kloss betyr ikke at de ikke har samme ane men de har arvet ulike segemeter av DNA. De vil da ikke kunne sammenlignes. 99% av alle tremenninger deler dna, går man en generasjon bakover vil 90% av firmenninger kunne bevise slektskap gjennom dna. femmenninger deler i 50% ikke dna med hverandre. Dette er fordi man arver ikke de samme bitene av sine forfedre.

(5) Alle er i slekt med seg selv

  • Alle sjekkes mot alle også seg selv, det er derfor at bilde sentrerer rundt en akse.

(6) Symmentri

  • Som nevnt i (5) sjekkes alle mot alle, man får derfor en akse. Denne gir en symmentri. Spiller derfor ingen rolle om man ser på en personene i venstre marg, eller starter med personene i liste øverst.
  • 4 stk i Gruppe 1 ser ut til å være tett i slekt med hverandre. Går man til høyre vil man se igjen dette innefor gruppe D (a)
  • 3×4 personer går igjen i bolker (a,b,c) som du ser nederst til høyre i bildet – (Klynge D). Antar at alle inne for hver av disse minigruppene er tett i slekt med hverandre.
  • Person d kobler minigruppe a med minigruppe b. Her må jeg undersøke videre hvordan de er innbyrdes i slekt med hverandre. Men det er klare indikasjoner på sammenhenger. Antar at Dale er lengre ned i treet enn Bernt eller omvendt (her må jeg sjekket nærmere hvilken retning dette viser)

(7) Alle må ikke dele samme segment for å utgjøre en klynge

  • Klynge C danner en pen firkant og alle matcher hverandre. Her tenker jeg at alle sammen deler samme segment. (Ved sjekk på kromosonleser ser jeg at alle triagulerer på det ene av 3 segmenter)
  • Klynge A er større og løsere sammensatt. Her er ikke alle tilsynelatende i slekt med alle andre, men alle er i slekt med noen som er i slekt med dem. Her vil det være folk på ulike grener hvor noen har arvet segmenter som andre grener har mistet disse.. Fragmenter av DNA som er felles binder disse sammen

Klyngerapporten

Noen mener at den viktigste delen av rapporten er oppsummeringen nederst. Første del er veldig visuell og kan gi deg en forsåelse av sammenhenger. Det hångripelige er oppsummert i listen nederst. Hver klynge finner du igjen i listen. Man ser navnet på Person som matcher (som også finnes på den visuelle). cM er totalt delt dna oppgitt i centiMorgan, den lengste blokken oppgis under «longest cM», så får du vite antall delte dna-biter (segmenter), hvilken klynge, for til slutt å få oppgitt hvor mange personer som finnes i slektstreet

Klynge C

1) Navn på treff

Ved å klikke på navnet til treffet får du vedkommende opp i 1-1 DNA sammenligning. Herfra kan du gjøre mye (dette skriver jeg mye om nå)

2) Notat

Teksten under navnet i feltet «Notes» finnes bare om man på forhånd har skrevet noe i notatfeltet på DNA treffet. Det flere veier til dette notatfeltet, det mest synlige er under «Undersøk DNA», som jeg har markert med 2 i bildet rett over. Er notat feltet utfyllt er boksen farget sterkt lilla. Hvordan du fyller ut dette feltet er opp til deg selv.. Foreløpig gjør jeg det på en bestemt måte (se nedenfor):

  • Første linje: bokstavkode for stien til kjent ane. (M-Mor, F-Far). En bostav for hvert ledd. Så navnet på denne personen,
  • Andre linje: Navn på foreldre som gav gav dna’et til denne personen, samt hvilken relasjon jeg har til tester 4C = femmenning.

3) Slektstre

Finnes testpersonen i ett slektstre så angis dette i siste kolonne i «treff-listen». I eksempleet over vet jeg at jeg har en mor, og barn. Hadde jeg ikke vist dette, eller om jeg lurete på hvilke slektskap det kan være mellom noen i treet får man først ett lite hint ved å se på antall medlemmer i treet. På første bilde ser jeg at det står 812 på 3 stk (De befinner seg i samme treet) Ved å klikke på tallet kommer man inn i slektsstreet og kan se om dette stemmer eller ikke. ett annet tips er å sjekke ut 1-1 på den med mest delt DNA/eller lengste segment. Nedenfor ser jeg at Suzette er mor til 3 barn som alle triangulrer med meg. Bare Allison og Kyle er i klynge 3 (C)

4a) Delte segment

Delte segemnt kan visualiseres via kromosonleseren- Man velger en eller flere personer i klyngen og ser om disse triangulerer på en eller flere segmenter. Jo flere man ser på jo mindre blir biten som er felles for alle. Eksempel nedenfor viser at alle matcher hverandre på ett segment, derfor har alle match mot hverandre i den gule klyngen C.

Listen sier at jeg deler 3 segmenter med noen, og 11 med Dag Albert. (tar ikke med alle hans segmeter). Som vist ovenfor har Suzette 3 barn. Alec er ikke med i klyngelisten. Dette er fordi det er en nedre grense for delt DNA på 30 cM og en øvre på 300 (derfor er heller ikke min foreldre eller søsken med i klyngelisten). Alec deler 27,9 med meg.

4b) Segmenter for klynge A

Klynga A
  • Alle i denne klyngen deler ett segment, selv om det ikke vises visuelt (lengst opp). Derek matchet ikke ifølge klyngerapporten Stephanie. Jeg er litt usikker på hvorfor dette skjer delt dna med meg er nesten identisk 32,4 & 32,3.
  • Maritha deler ikke segmenter på kromoson 15 med de andre, men kan se ut til å ha arvet en annen bit i forlengelsen av de andre. Dette tyder på at hun sitter på en annen gren av samme familie. Hun er ikke med i A klynga. Hun deler 20,1 cM med de andre og er av den grunn ikke med.

Oppsummering

Klynger er veien å gå for å finne flere som hører sammen i samme slekt, men kan ikke brukes alene. Å sortere folk i grupper av slektninger er noe av det mest nyttige man kan gjøre for å skjønne sin slekt, og arv av segmenter på kromosonene.

Det er viktig å dokumentere underveis om du finne ut av en forbindelse. Bruk notatfeltet aktivt.

Det skal bare en person til for å finne ut av hvor en gruppe mennesker hører hjemme. Det aller viktigste man gjør er å skille hvem som tilhører farssiden eller morsiden av familien, dna-messig. (Her forventer jeg at test-selskapene finner gode måter å sortere hver eneste «bokstav» på vårt DNA for hver kromoson i fremtiden. Men dette krever høy grad av samtykke mellom slekt. At vårt dna er usortert mht far/mor er trolig årsaken til de fleste misforståelser)


Klynger er en del av det jeg kaller slektforskningens treenighet

Visuell fasing – DNA Painter


Med DNA Painter kan man visuelt tegne opp dine DNA treff. Disse kan senere hjelpe deg å bestemme hvor andre hører hjemme dersom disse ikke har ett slektstre å vise til.

Dette trenger du:

  • DNA treff som du vet hvor denne hører hjemme i ditt slektstre.
  • Liste over kromosomer som dere har felles (delte segmenter)
  • Konto hos DNA Painter (en profil er gratis) $30 for 6 mnd og $55 for 12 mnd.

Har man funnet ut av ett treff kan dette hjelpe deg videre med andre treff. Alle andre som passer i mellom*) vil enten være i slekt via samme anepar, eller lengre opp i ane rekka.

*) De fleste snubler her – Gitt at de matcher på samme segment (og ikke det samme område som motsatt foreldre har gitt deg).

Det finnes måter å finne ut av dette på, kalles triangulering. Om ABC matcher på samme segment, må de match hverandre innburdes også. A->B, A->C og B->C om ikke siste er tilfelle. Betyr dette: Siden du (A) har ett kromosonpar så kan B Match din morsside og C din farsside. Derfor vil ikke B og C matche hverandre. Hos ftDNA bruker man Matrix, MyHeritage har merker trangulerte på Kromosonleseren. Gedmatch har også verktøy for triangulering.

Overlappende segmenter kan bety at man har arvet disse fra felles forfedre. Alle andre som havner under dette delte segmentet kan derfor være i slekt med deg. Forutsatt at det er på samme segmentparet. (Som nevent overor har man alltid 2 ett kromoson fra fra og ett fra mor). år du ser på leverandørenes kromosonleserer må du være klar over at den bruker begge dine sider mot andre. Du kan ha segment treff som er overoptemistiske, hvor du har treff mot begge sider.

Pratisk eksempel

Først av alt, jeg har ikke DNA etter mine besteforeldre, men begge mine foreldre. Jeg kan enkelt fase miitt DNA i min mors bidrag og fars bidrag. (Enkelt eksempel på fasing). Utfordingen mange har er at de ikke har en forelder som er testet. Hvordan skal man da fase DNA’et. Dette et eksempel

Most Common Recent Ancestor

Siden jeg vet at dette treffet går via min mors mors linje kan jeg derfor fase de delte segmentene mellom min mor f. Grøndahl og herr Svendsen. Digresejon dette er det næremste treffet hun har utenom meg og hennes barnebarn. Denne personen er heller ikke på Gedmatch, eller ftDNA. Om jeg ikke hadde overført mine rådata til MyHeritage ville jeg trolig aldri funnet at han hadde tatt en DNA test.


Man laster ned delt segementer via kromosonleseren (øverst til høyre)

Fra før har en en tom profil opprettet for min mor. For å «male» dette treffet inn velger jeg å importere fila jeg lastet ned i bildet ovenfor.

  • Åpner nedlastet fil i notisblokk (eller excel), kopierer innhold
  • Åpne profil i DNA painter
  • Klikker på «Paint new match»
  • Lim inn innhold fra nedlastet fil
  • Klikk «Save match now»

Redigerer kjent ane. Bruker Prefiks MMF for Mor Mor’s Foreldre. Setter slektside (Maternal), og en lite notat hvor informasjonen kom fra

Jeg kunne ha valgt en annen fremgangsmåte. Import data direkte fra fil dette krever betalt medlemskap (noe som jeg har)

En annen gang skal jeg vise hvordan dette vil se ut med flere delte segementer og hva man kan lese ut av dette

Norwegian Gedmatch DNA Matching


Hvem av dine treff på Gedmatch er også på facebook?

Noe som kan gjøre det lettere å komme i kontakt med disse personene, og samarbeide videre. Det finnes flere slike grupper, de tar for seg en bestemt region eller land.  feks: 

Gruppene er internasjonale så skriv helst på engelsk. 

Før du starter må du ha overført data til Gedmatch, eller Gedmatch Genesis

Hva trenger du før du begynner?

  1. Smør tålmodighets muskelen. Du MÅ følge bruksanvisningen til punkt og prikke.
  2. Skaff deg Gedmatch konto, slik at du får en Gedmatch ID
  3. Google konto – Du trenger ikke gmail adresse, men må være registret hos Google slik at du får tilgang til å laste ned regnearket senere
  4. Du må ha PC eller Mac (Man kan ikke bruke nettbrett eller mobil)
    Nettleser som støttes er: Chrome, Firefox, Safari, Opera.
    • OBS OBS ikke Microsoft sin nettleser virker ikke
  5. Meld deg inn i facebook gruppa:  Norwegian Gedmatch DNA Matching

Fremgangsmåte:

  • Alt på listen ovenfor må være på plass. Har du ikke dette i orden – start forfra.
  • Finn frem din Gedmatch ID, og ditt facebook navn.
  • Svar på 3 spørsmål i spørreundersøkelse  – https://bit.ly/2IdjRdU
    1. Gedmatch/Gedmatch Genesis ID
    2. Ditt facebook navn
    3. Din status i gruppen (1. venter på godkjenning, 2. medlem fra før m nytt kit, 3. vet ikke)
  • Vent minst 24 timer, slik at info kan legges inn i databasen. NB Ha tålmodighet !
  • Logg på Gedmatch
    1. velg ‘One-to-Many’ matches
    2. vent til listen er ferdig generert. Det skal stå noe ala dette nederst under tabellen.
    3. Tast CTRL+A (for å velge alt på nettsiden), så CTRL+C for å kopiere (alt)
2000 matches (6000 – 2237 rows)Query time = 0.28 – Total Search time = 1.79 secondsMatches Excluded – Not Public: 228 – F1: 0 – No Link: 9 – Short Shared: 0 – Duplicate: 0

Fortsettelse: (Gjenta med jevne mellomrom)

  • Last ned regneark – (trykk på knapp – Lag kopi) https://docs.google.com/spreadsheets/d/1tUzJ72JK5NkKRaRWMDAm10VU3FAq4G-l3or8_GvuHhU/copy
  • Etter at regnearket har åpnet seg (du ser ett bilde). Før du gjøre noe som helst, lim inn data fra Gedmatch med å taste CTRL+V.  NB NB Viktig at du ikke klikker i regnearket før du gjør dette.
  • Vent 5-10 min
  • Når data dukker opp i regnearket gå til fane “Matches”. (Statuslinje øverst til høyre vil vise seg)
  • Ta skjermbilde – helst utsnitt av ny treffliste
  • Del bilde i – Norwegian Gedmatch DNA Matching –  “Tag” medlemmene som dukker opp

Gjenta fremgangsmåte «Fortsettelse» med jevne mellomrom (Månedlig/kvartalsvis)

“Check your Data” 

  • En test du kan kjøre i regnearket, for å se om du kan starte.
  • Legg inn din Gedmacth ID, ditt navn bør dukke under, dersom ikke.
  • Ventet du 24t under punkt fjerde kulepunkt?
  • Du må også vente med å laste ned regnearket til du er lagt inn i databasen. Du kan ikke vente 24 t og bruke regnearket pånytt. Du må vente med å hente kopi, som har deg innlagt

Dette dokumentet på Google disk

Klyngetriks i FamilyTreeDNA


Dine DNA-treff kan hjelpe deg, om du vet hvordan å bruke de. Ved å ha ett bevisst forhold til hvem av dine treff du har lenket inn i ditt tre kan du la disse jobbe for deg. Denne artikkelen viser noen tips i denne sammenheng. 

Dette er utdyping av en åpenbaring jeg nevnte på  Facebook Gruppen – «Norway DNA – Norges prosjektet FTDNA» 

Bakgrunn: Jeg hadde slurvet med oppfølging av min mors DNA treff på FamilyTreeDNA (ftDNA), og tenkte jeg skulle gjøre noe med det. Tanken var at siden jeg lekt litt med DNA Painter (DP), skulle jeg legge alle de treffene jeg hadde «løst» inn i DP. På min mors profil i ftDNA var det bare 1 person utenom min sønn og meg, som var lenket. Han er en firmenning (3C-third cousin). Hun har også treff på MyHeritage, og der hadde hun 2 jeg hadde funnet ut av. (Tremenning – 2C og 2C1R) 

Plukket først ut firmenning treffet i ftDNA, og skulle legge bare den inn, men startet på nytt fordi jeg fikk spørsmål om hvilken side kromosomene tilhørte. ftDNA har jo røde damer og blå menn. Tenkte derfor «hva om jeg legger inn alle som er faset på ftDNA?»

Treffene er anonymisert. Siden få personopplysninger avsløres kunne dette stått usladdet

Bare 18 personer er faset hos min mor, og bare på hennes mor’s side (Paternal=0, Maternal=18). Tenkte ikke noe videre på dette først, men dette er en del av observasjonen som følger

Siden DNA painter spør om hvilken side data kommer fra, tenkte jeg det er kjempesmart å plukke alle disse, og sette de på hennes morsside. Fordi poenget for meg er å se hvem andre som matcher oss, utelater derfor oss min sønn og meg, når jeg skal se videre på segmenter.

Via kromosonleseren får man tak i segmentene til DNA Painter
Man kan velge maks 7 personer

I kromosonleseren til ftDNA kan man filtrere på «maternal side» (morssiden). Prøvde å laste ned alle 18(-2) i utvalget, men fant ikke noen enkel måte å gjøre dette på. «Download all segments» er absolutt alle, uansett hvilken avgrensning man gjør på siden. Måtte derfor ta 7 og 7 om gangen (og tilslutt 2). se bilde under

Lastet ned segmentene til disse 14 til PC’en. DNA Painter har nå en funksjon å laste inn mange segmenter fra flere i en jafs. (Masse import). Hadde 3 filer, Det ble derfor 3 grupper i DP. Senere slo jeg sammen disse 3 gruppene til en gruppe, som jeg kalte «ftDNA Maternal Matches Runa Holte»

«Import data» takler segmenter fra 1 fil med flere personer i en jafs
Justerte segment nivå, før jeg valgte fil, og trykket import
View Group: Herfra kan jeg slå sammen grupper

I ftDNA listen dukket ett navn opp, men det var ikke noe tre. Mente jeg hadde sett dette navnet før, og kikket på MyHeritage. Digresjon: dette var ett hendig uhell, min mor har en tremenning med samme fornavn, men annet etternavn. Men fant også denne personen hos MyHeritage. Etter å ha sjekket smart match’ene,  fant jeg veldig raskt ut hvem felles ane var; samme anepar som jeg først jobbet med. Treffet blir mao firmenning forskjøvet ett ledd.

Sakte begynte ting å falle på plass for meg.

En lenket person, gav meg følgende:

ftDNA plukker ikke vilkårlig ut og faser hvem som tilhører hvilken side. Alle som match’er gitte kriterier, blir faset. De er alle antagelig i slekt (IBS – Identified by state). Med bare 1 person lenket vil andre som faser, tilhøre samme familieklynge (cluster). Alle tilhører samme samme slektslinje min mors tippoldeforeldre ligger på. Min (mors) mors mors fars foreldre. Dette vil være informasjon som en match trenger for å finne ut av ting på sin side, eller du trenger om du gjør mer slektsforskning på egenhånd.

OBS! Det er en sjanse for feil/avvik når man sammenligner data. Senere funn kan plukke noen ut av din familieklynge siden. Disse tilfeldige treff kalles (IBC – Identified by chance). 

Om jeg bare legger til folk i treet som tilhører denne gruppen vil jeg kunne finne flere biter av felles denne gruppens felles dna pool. Ved å være bevisst på hvem man har koblet inn i treet har man en enkel måte å klynge slekt på. «Fattigmanns klynge verktøy», bruk 1 lenket person til å bygge denne personens familieklynge.

Lenker man til flere personer, vil dette kunne endre hvem som faser. De på samme side, vil bidra til å avdekke opp hvilke segmenter min mor har fått på den siden. DNA Painter visualiserer hvilke områder som blir avdekket. På den måten kan jeg vite hvilke mer om hvordan hennes dna er faset. Noe som igjen kan brukes til å rekonstruere biter av forefedres dna. Målet er å dele alt DNA inn ente far og mors side.

Verdt å merke seg:

Om du lenker ikke flere matcher, vil du etterhvert se at noen blir lilla. Dette er personer som kan være i slekt med både din mor og far. Disse bør du ikke bruke når du kartlegge videre. 

Bruker man alle i trefflisten i DNA Painter, men ikke de som er nære (kutt de med mer enn 1500 centimorgen), ser man hvor stor grad det teoretisk er mulig å fase/rekonstruere dna. Det vil alltid komme flere til, jo flere som tester seg jo bedre dekning kan man få.

Alle mine mors ftDNA treff. Bilde viser potensielet for å visuelt kartlegge hennes dna